Abstract
- Emmascarament de la seqüència amb el programa RepeatMasker . Considerem que les regions que presenten repeticions no seran codificants; aleshores, no ens interessaran alhora de predir els gens amb els programes. - Predicció dels gens de la seqüència mitjançant els programes geneid , genscan , fgenesh i grail . - Validar els resultats aliniant amb les bases de dades de ESTs. - Dividir la nostra seqüència inicial en blocs que contenen les coordenades dels gens millor predits amb diferents programes. Així, per exemple, mirem les coordenades del gen 1 que prediuen genescan i geneid i delimitem aquesta subseqüència, de la qual tornarem a fer un anàlisis més exhaustiu amb els ESTs i , si s'escau, els ESTs filtrats. - Finalment, realitzarem un estudi de les regions promotores ( 300 pdb per sobre de la regió d'inici de transcripció) amb el programa TRANSFAC |