10 20 30 40 50 60
....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
consensus ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 1495292 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 47008 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 128305 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 6225637 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 11362819 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 544128 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 14285533 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 3258369 1 mkavilaagkgerlrpltddrpkpilkiankpiieyilenldpfvdefiivvkykkekii 60
|
70 80 90 100 110 120
....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT 1 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~mqqlqnviesaferraditpanvdtvtreavnqvigl 37
consensus ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 1495292 1 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~mknvaivgdggh 12
gi 47008 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 128305 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 6225637 1 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~mkvhssvliegeveipedv 19
gi 11362819 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 544128 1 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~mffrmlkedidtvfd 15
gi 14285533 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 3258369 61 etlgdefhgkpityvvqgdeegtaraiysakdaiideeffaingdiyfeqeairgllhty 120
|
130 140 150 160 170 180
....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT 38 ldsgalrvaekidgqwvthqwlkkavllsfrindnkvmdgaetryydkvpmkfadydear 97
consensus ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 1495292 13 gkvirelinarsdtrlaavlddkfktfeggkewytgppkavtelrrlipdvlfliavgnn 72
gi 47008 1 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~mfvyslrlklnli 13
gi 128305 1 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~msllaqwredircvfe 16
gi 6225637 20 eigaytviqgnvkigkgtkignrvtikgnvtigenckifdgavigeapqhlkyegeetsv 79
gi 11362819 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 544128 16 qdpaarsyfeviltysglhaiwahriahalykrkfyflarlisqvsrfftgieihpgati 75
gi 14285533 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 3258369 121 rkmkadggivvkkfenlsqlglvevknnlvkkiiekpgkmegfanlgiyifnsevfdfie 180
|
190 200 210 220 230 240
....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT 98 fqkegfrvvppatvrqGAFIARn~TVLMP~~SYVNIg~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AYV 134
consensus 1 ~~~~~~~~~~~~~~~~GVVIGDg~VVIGAn~VVIGPg~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVI 22
gi 1495292 73 svrkqlaerlglgkddFITLIHp~SAIVSksAVIGEgtv~~~~~~~~~~~~~~~imaGAI 116
gi 47008 14 isllskvrrkskakflVLLSGYdfKMVGKn~FKLNVkpysaknntsskwgsmrvgdnCWI 72
gi 128305 17 rdpaarttfevlttypGVHAIMl~YRLAHr~LWRPNa~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LPR 54
gi 6225637 80 eignnviireyvtihrGTKLDKgkTVVGDn~VMLMA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YSH 117
gi 11362819 1 ~~~mdqmlenhvfsgiHGTVESg~VTLKNi~EKIEIae~~~~~~~~~~~~~~~~~~dAYV 37
gi 544128 76 grrffidhgmgvvigeTCEIGNn~VTVFQg~VTLGGtgkekgkrhptikddaliatgAKV 133
gi 14285533 1 ~~~~~~~~~~mtnihpTAIVEDg~ARIGNn~VTIEPy~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AIV 28
gi 3258369 181 eteksergeyeitdtiNIMIERg~KRIVYf~EYKGFw~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SDI 218
|
250 260 270 280 290 300
....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT 135 DEg~TMVDT~~~~~WATVGSc~~~~~~~~~~~~~~AQIGKn~VHLSG~~GVGIGgvlep~ 170
consensus 23 GDg~VVIGD~~~~~GVVIGGg~~~~~~~~~~~~~~VVIGDn~VVIGA~~GVVIGg~~~~~ 54
gi 1495292 117 IQadARIGA~~~~~HCIINTgavaehd~~nqisdyVHLSPr~ATLSG~~AVSVQe~~~~~ 161
gi 47008 73 EAv~YNYGDekfepYLYIGDriclsdnvhiscvscLILENd~ILIGS~~KVYIGdhshgs 128
gi 128305 55 PAavVRARL~~~~~VSNVDIhp~~~~~~~~~~~~gAVIGAr~FFIDHgaCVVIGe~~~~~ 91
gi 6225637 118 VAh~DCVVG~~~~~NNVIMAn~~~~~~~~~~~~~cATLGGh~VVVGD~~YALIGg~~~~~ 150
gi 11362819 38 ESg~AYIVG~~~~~PCILGSq~~~~~~~~~~~~~~TEVRHg~AYLRG~~NVITGs~~~~~ 69
gi 544128 134 LGs~ITVGE~~~~~GSKIGAgsv~~~~~~~~~~vlHDVPDfsTVVGI~~PGRVVvqngkk 175
gi 14285533 29 KKn~VTLCD~~~~~DVVVKSy~~~~~~~~~~~~~~AYIDGf~TTIGR~~GTTVWp~~~~~ 60
gi 3258369 219 GRp~WDLLE~~~~~VNEYILktklk~~~~~~hnirGTVEEg~ATIIP~~PVEIGe~~~~~ 258
|
310 320 330 340 350 360
....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT 171 ~~~~~~~~~~~~~lqanpTIIEDn~~CFIGARSEVVEgviveegsvismgvylgqstriy 215
consensus 55 ~~~~~~~~~~~~~~~~~gVVIGDg~~VVIGAGVVIGG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 72
gi 1495292 162 ~~~~~~~~~~~~~~~~~gAHVGTg~~ASVIPQIIIGAwsivgagsavirsipdrvtaaga 202
gi 47008 129 ~~~~~~~~~~~~~ykvcsPKIEPpanKPLGDIAPIKIgnccwigdnavilagseicdgcv 175
gi 128305 92 ~~~~~~~~~~~~~~~~~tAEIGRd~~VTLYHGVTLGGttgakgkrhptlgdvvlvgagak 132
gi 6225637 151 ~~~~~~~~~~~~~~~~~lSAVHQw~~ARVGEHAMVGGltgvsldippytvasgqhaklyg 191
gi 11362819 70 ~~~~~~~~~~~~~~~~~rCVVGHc~~TEIKNSYLGHHtkaahfaylgdsvlssevnlgag 110
gi 544128 176 vrrdlnhqdlpdpvadrfKSLEQ~~~QILELKAELEDrkerinqk~~~~~~~~~~~~~~~ 217
gi 14285533 61 ~~~~~~~~~~~~~~~~~sAMIGNk~~PQDLKFKGEKTfveigehceirefamitsstfeg 101
gi 3258369 259 ~~~~~~~~~~~~~~~~~gTIVRSg~~SYIIGPVKIGKncrigpncfirpytsigdnchig 299
|
370 380 390 400 410 420
....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT 216 dretgeihygrvpagsvvvsgnlpskdgsyslycavivkkvdaktrgkvginellrtid~ 274
consensus ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 1495292 203 pariissiqtsnkg~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 216
gi 47008 176 iaansvvkdlkvdkpcliggvpakvikvf~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 204
gi 128305 133 ilgpitiganarvgansvvvqdvpegctvvgipgkvvklreagqlnpygidldhhlipdp 192
gi 6225637 192 iniiglrrrgfpeevikaiskayriifrsplprqkapeivfqelgqyeevrkmvefikss 251
gi 11362819 111 vrcanfrldgrniyvrstsdkskkidtgrrklgaflgkgvaigcnvvinpgqhilphtri 170
gi 544128 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 14285533 102 ttvsignnclimpwahiahncsvgnnvvfsthvqlaghvqvgdcvtigsmvgvhqfvrig 161
gi 3258369 300 navevknsiimdnsnaphlnyvgdsiigentnlgagtitanlrhdnktvkveikgnleds 359
|
430 440 450 460 470 480
....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
consensus ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 1495292 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 47008 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 128305 193 vgkaiaclleridslekrveagglvaaaasstfyegcnpdnsicetnlrrsapwssgrpr 252
gi 6225637 252 krgvarhhkd~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 261
gi 11362819 171 rpgqvi~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 176
gi 544128 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 14285533 162 sysmvgamsgirrdippftigtgnpyalgginkvglqrrqvsfetrlaliktfkrvfrsd 221
gi 3258369 360 grrklgaiighnvktginvsiypgrkigsgalvgpgvivdknippgvlvvakqekmvtkr 419
|
490 500 510 520 530
....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....
3TDT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
consensus ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 1495292 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 47008 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 128305 253 rpahagdrvsgrakgsd~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 269
gi 6225637 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 11362819 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 544128 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 14285533 222 esfqaslesvledfgevpevrhfvefcrqpskrgiergvdceasleepidkkegafves 280
gi 3258369 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
|