10        20        30        40        50        60
                ....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT            ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
consensus       ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 1495292      ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 47008        ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 128305       ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 6225637      ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 11362819     ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 544128       ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 14285533     ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 3258369    1 mkavilaagkgerlrpltddrpkpilkiankpiieyilenldpfvdefiivvkykkekii 60
                        70        80        90       100       110       120
                ....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT          1 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~mqqlqnviesaferraditpanvdtvtreavnqvigl 37
consensus       ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 1495292    1 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~mknvaivgdggh 12
gi 47008        ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 128305       ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 6225637    1 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~mkvhssvliegeveipedv 19
gi 11362819     ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 544128     1 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~mffrmlkedidtvfd 15
gi 14285533     ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 3258369   61 etlgdefhgkpityvvqgdeegtaraiysakdaiideeffaingdiyfeqeairgllhty 120
                       130       140       150       160       170       180
                ....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT         38 ldsgalrvaekidgqwvthqwlkkavllsfrindnkvmdgaetryydkvpmkfadydear 97
consensus       ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 1495292   13 gkvirelinarsdtrlaavlddkfktfeggkewytgppkavtelrrlipdvlfliavgnn 72
gi 47008      1 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~mfvyslrlklnli 13
gi 128305     1 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~msllaqwredircvfe 16
gi 6225637   20 eigaytviqgnvkigkgtkignrvtikgnvtigenckifdgavigeapqhlkyegeetsv 79
gi 11362819     ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 544128    16 qdpaarsyfeviltysglhaiwahriahalykrkfyflarlisqvsrfftgieihpgati 75
gi 14285533     ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 3258369  121 rkmkadggivvkkfenlsqlglvevknnlvkkiiekpgkmegfanlgiyifnsevfdfie 180
                       190       200       210       220       230       240
                ....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT         98 fqkegfrvvppatvrqGAFIARn~TVLMP~~SYVNIg~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AYV 134
consensus     1 ~~~~~~~~~~~~~~~~GVVIGDg~VVIGAn~VVIGPg~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVI 22
gi 1495292   73 svrkqlaerlglgkddFITLIHp~SAIVSksAVIGEgtv~~~~~~~~~~~~~~~imaGAI 116
gi 47008     14 isllskvrrkskakflVLLSGYdfKMVGKn~FKLNVkpysaknntsskwgsmrvgdnCWI 72
gi 128305    17 rdpaarttfevlttypGVHAIMl~YRLAHr~LWRPNa~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LPR 54
gi 6225637   80 eignnviireyvtihrGTKLDKgkTVVGDn~VMLMA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YSH 117
gi 11362819   1 ~~~mdqmlenhvfsgiHGTVESg~VTLKNi~EKIEIae~~~~~~~~~~~~~~~~~~dAYV 37
gi 544128    76 grrffidhgmgvvigeTCEIGNn~VTVFQg~VTLGGtgkekgkrhptikddaliatgAKV 133
gi 14285533   1 ~~~~~~~~~~mtnihpTAIVEDg~ARIGNn~VTIEPy~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AIV 28
gi 3258369  181 eteksergeyeitdtiNIMIERg~KRIVYf~EYKGFw~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SDI 218
                       250       260       270       280       290       300
                ....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT        135 DEg~TMVDT~~~~~WATVGSc~~~~~~~~~~~~~~AQIGKn~VHLSG~~GVGIGgvlep~ 170
consensus    23 GDg~VVIGD~~~~~GVVIGGg~~~~~~~~~~~~~~VVIGDn~VVIGA~~GVVIGg~~~~~ 54
gi 1495292  117 IQadARIGA~~~~~HCIINTgavaehd~~nqisdyVHLSPr~ATLSG~~AVSVQe~~~~~ 161
gi 47008     73 EAv~YNYGDekfepYLYIGDriclsdnvhiscvscLILENd~ILIGS~~KVYIGdhshgs 128
gi 128305    55 PAavVRARL~~~~~VSNVDIhp~~~~~~~~~~~~gAVIGAr~FFIDHgaCVVIGe~~~~~ 91
gi 6225637  118 VAh~DCVVG~~~~~NNVIMAn~~~~~~~~~~~~~cATLGGh~VVVGD~~YALIGg~~~~~ 150
gi 11362819  38 ESg~AYIVG~~~~~PCILGSq~~~~~~~~~~~~~~TEVRHg~AYLRG~~NVITGs~~~~~ 69
gi 544128   134 LGs~ITVGE~~~~~GSKIGAgsv~~~~~~~~~~vlHDVPDfsTVVGI~~PGRVVvqngkk 175
gi 14285533  29 KKn~VTLCD~~~~~DVVVKSy~~~~~~~~~~~~~~AYIDGf~TTIGR~~GTTVWp~~~~~ 60
gi 3258369  219 GRp~WDLLE~~~~~VNEYILktklk~~~~~~hnirGTVEEg~ATIIP~~PVEIGe~~~~~ 258
                       310       320       330       340       350       360
                ....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT        171 ~~~~~~~~~~~~~lqanpTIIEDn~~CFIGARSEVVEgviveegsvismgvylgqstriy 215
consensus    55 ~~~~~~~~~~~~~~~~~gVVIGDg~~VVIGAGVVIGG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 72
gi 1495292  162 ~~~~~~~~~~~~~~~~~gAHVGTg~~ASVIPQIIIGAwsivgagsavirsipdrvtaaga 202
gi 47008    129 ~~~~~~~~~~~~~ykvcsPKIEPpanKPLGDIAPIKIgnccwigdnavilagseicdgcv 175
gi 128305    92 ~~~~~~~~~~~~~~~~~tAEIGRd~~VTLYHGVTLGGttgakgkrhptlgdvvlvgagak 132
gi 6225637  151 ~~~~~~~~~~~~~~~~~lSAVHQw~~ARVGEHAMVGGltgvsldippytvasgqhaklyg 191
gi 11362819  70 ~~~~~~~~~~~~~~~~~rCVVGHc~~TEIKNSYLGHHtkaahfaylgdsvlssevnlgag 110
gi 544128   176 vrrdlnhqdlpdpvadrfKSLEQ~~~QILELKAELEDrkerinqk~~~~~~~~~~~~~~~ 217
gi 14285533  61 ~~~~~~~~~~~~~~~~~sAMIGNk~~PQDLKFKGEKTfveigehceirefamitsstfeg 101
gi 3258369  259 ~~~~~~~~~~~~~~~~~gTIVRSg~~SYIIGPVKIGKncrigpncfirpytsigdnchig 299
                       370       380       390       400       410       420
                ....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT        216 dretgeihygrvpagsvvvsgnlpskdgsyslycavivkkvdaktrgkvginellrtid~ 274
consensus       ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 1495292  203 pariissiqtsnkg~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 216
gi 47008    176 iaansvvkdlkvdkpcliggvpakvikvf~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 204
gi 128305   133 ilgpitiganarvgansvvvqdvpegctvvgipgkvvklreagqlnpygidldhhlipdp 192
gi 6225637  192 iniiglrrrgfpeevikaiskayriifrsplprqkapeivfqelgqyeevrkmvefikss 251
gi 11362819 111 vrcanfrldgrniyvrstsdkskkidtgrrklgaflgkgvaigcnvvinpgqhilphtri 170
gi 544128       ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 14285533 102 ttvsignnclimpwahiahncsvgnnvvfsthvqlaghvqvgdcvtigsmvgvhqfvrig 161
gi 3258369  300 navevknsiimdnsnaphlnyvgdsiigentnlgagtitanlrhdnktvkveikgnleds 359
                       430       440       450       460       470       480
                ....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|
3TDT            ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
consensus       ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 1495292      ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 47008        ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 128305   193 vgkaiaclleridslekrveagglvaaaasstfyegcnpdnsicetnlrrsapwssgrpr 252
gi 6225637  252 krgvarhhkd~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 261
gi 11362819 171 rpgqvi~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 176
gi 544128       ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 14285533 162 sysmvgamsgirrdippftigtgnpyalgginkvglqrrqvsfetrlaliktfkrvfrsd 221
gi 3258369  360 grrklgaiighnvktginvsiypgrkigsgalvgpgvivdknippgvlvvakqekmvtkr 419
                       490       500       510       520       530
                ....*....|....*....|....*....|....*....|....*....|....*....
3TDT            ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
consensus       ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 1495292      ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 47008        ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 128305   253 rpahagdrvsgrakgsd~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 269
gi 6225637      ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 11362819     ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 544128       ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
gi 14285533 222 esfqaslesvledfgevpevrhfvefcrqpskrgiergvdceasleepidkkegafves 280
gi 3258369      ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~