Conclusions


Un cop realitzats tots els anàlisis concluim que en la seqüència AC091491 del cromosoma 3 hi ha un gen. Aquest gen ha estat predit tant pel Geneid com pel Genscan en reverse. La predicció del Geneid només mostra un exó no soportat per spliced ESTs mentre que a la predicció del Genscan en trobem quatre de no validats. D'altra banda l'exó inicial predits pels dos programes en extendre la seqüència tampoc està validat per la presència de spliced ESTs. Amb els resultats obtinguts amb BLAST i CLUSTAL podem dir que el gen predit correspon a la proteïna fosfolipasa C2 la qual es troba localitzada en el nostre contig. Comparant la predicció dels dos trànscrits d'aquesta proteïna obtingudes per l'Ensembl amb les prediccions del Geneid i el Genscan veiem que els exons interns i el terminal suportats per spliced ESTs corresponen els exons dels dos trànscits de l'Ensembl, i per contra, que l'exò inicial predit no hi correspon; ja que trobem un inicial diferent per cada un dels trànscrits predits per l'Enseml en posicions força allunyades del primer exó intern. Repetint l'anàlisi amb la seqüència extesa sense emmascarar segueixen sense predir-se cap dels dos possibles exons inicials. Per tal de trobar alguna evidència de l'existència d'aquests exons en la nostra seqüència i confirmar que l'exó inicial de les prediccions de Genscan i Geneid és un fals positiu hem estudiat les regions upstream de 500pb de cada un d'ells per tal de trobar-hi possibles promotors. D'aquesta manera la nostra hipòtesi ha quedat reforçada en trobar regions TATA box en les regions upstream de cada un dels dos trànscrits i cap en la regió upstream de l'exó inicial del gen predit "ab initio".




Fig 16. Resultats finals de l'anàlisi