COMANDOS EN PERL PARA CORRER EN PATSCAN EL PATRÓN DE LA ACONITASA MITOCONDRIAL
- Correr el patrón
sobre las secuencias del aconitasas mitocondriales:
$scan_for_matches
aconitasepattern.txt <
training.fa
- Correr el patrón
sobre las secuencias 5' sin IREs:
$scan_for_matches aconitasepattern.txt < no_ires_5'.fa
- Correr el patrón
sobre las secuencias 3' sin IRES:
$scan_for_matches aconitasepattern.txt < no_ires_3'.fa