COMANDOS EN PERL PARA CORRER EN PATSCAN EL PATRÓN DE LA TRANSFERRINA
- Correr el patrón
sobre las secuencias del grupo de ensayo:
$scan_for_matches
transferrinpattern.txt <
training.fa
- Correr el patrón
sobre las secuencias del grupo de test:
$scan_for_matches transferrinpattern.txt <
test.fa
- Correr el patrón
sobre las secuencias 5' sin IREs:
$scan_for_matches transferrinpattern.txt < no_ires_5'.fa
- Correr el patrón
sobre las secuencias 3' sin IRES:
$scan_for_matches transferrinpattern.txt < no_ires_3'.fa