BUSCOEXON
Bioinformática
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P0 A C G T 01 -0.459 0.241 -0.409 0.357 02 -0.495 0.252 -0.540 0.418 03 -0.511 0.192 -0.495 0.456 04 -0.614 0.280 -0.639 0.474 05 -0.775 0.305 -0.642 0.504 06 -0.955 0.304 -0.666 0.557 07 -1.061 0.258 -0.768 0.639 08 -1.176 0.300 -0.788 0.634 09 -1.302 0.238 -0.923 0.723 10 -1.227 0.388 -0.881 0.597 11 -1.049 0.341 -0.773 0.577 12 -1.007 0.460 -0.758 0.458 13 -1.163 0.525 -1.188 0.526 14 -1.311 0.582 -1.401 0.527 15 -1.093 0.414 -1.503 0.657 16 0.030 0.151 -0.117 -0.086 17 -1.860 1.093 -4.269 -0.165 18 0.00 -9999 -9999 -9999 19 -9999 -9999 0.00 -9999 20 -0.064 -0.513 0.732 -0.957 21 -0.075 -0.220 -0.087 0.302 XX 20
Debe ponerse un -9999 en los nucleótidos que no son
A,G (si es acceptor) o G,T (si es donnor)
en las posiciones que corresponden a dichos nucleótidos.
Bajar Matriz de acceptors
Bajar Matriz de donnors
Siguiendo el ejemplo que he usado, el programa se ejecuta: Una vez ejecutado el programa podemos variar los Se debe tener en cuenta que la primera posición de la secuencia Funciona con 7 argumentos:
Ejecución:
Obteniendo el siguiente resultado, en formato GFF:
Comentarios:
tres últimos parárametros para regular la cantidad de
exones internos que nos devuelve el programa.
es la posició:n 0 cuando observemos
las posiciones de principio y fin de exón.